Woher kam die SARS-CoV-2 Omikron Variante?

Ein Familienstammbaum der verschiedenen SARS-CoV-2 Varianten. Quelle: nextstrain github (created by Emma Hodcroft)
Anteil an SARS-CoV-2 Neuinfektionen durch die Omikron Variante. Quelle: Our World in Data

Die tierischen Ursprünge von Omikron?

Unterschiedliche Mutationsspektren zwischen ‘frühen’ Omikron Genomen (Mitte) im Vergleich zu späteren Omikron Genomen (rechts) und generellen Mutationen in SARS-CoV-2 (links). Quelle: Wei. et. al, 2020, bioarxiv
Mutationsspektren von Coronaviren aus gleichem Wirtstierhintergrund sind einander ähnlicher als Spektren aus anderen Säugetieren. Kreise bezeichnen das 95% Konfidenzintervall. Quelle: Wei. et. al, 2020, bioarxiv

Von Ratten und Menschen

Die Ausbreitung der Omikron Variante in südafrikanischen Provinzen erfolgte rasant, schon innerhalb weniger Wochen wurde eine Delta Welle durch Omikron ersetzt. Source: Viana R. et al., medxiv, 2021
Probleme mit Müllbeseitigung und Abwasserentsorgung führen zu Rattenplagen [Image Credit: Angela Mathee]

Die mysteriöse Epidemiologie der Omikron Linien

Omicron-Mutationen im Vergleich zu anderen häufigen SC2-Spike Mutationen und ihrem beobachteten tierischen Hintergrund. Originalbild aus Teleneti et. al, Nature, 2021. [Bearbeitet von Professor Robert F. Garry, Tulane University, für Virological]

Was ist mit chronisch immunkomprimierten Patienten?

SARS-CoV-2 viren in HIV Patienten entwickeln mehrere Mutationen die Omikron ähneln. Source: Cele S. et al., Cell Host & Microbe, 2022
Venn-Diagramm, das die Ähnlichkeiten und Unterschiede zwischen den drei Omicron Unterlinien zeigt. Bildquelle: Access Health International für Forbes
Kristian G. Andersen in einem Online-Gespräch mit Andrew Rambaut, mir und vielen anderen über die mysteriösen Ursprünge von Omicron. Quelle: Twitter
Durchimpfung in Afrika hängt der restlichen Welt weit hinterher. Quelle: Our world in data
  1. Kupferschmid Kai, Science, 2021
  2. Wei C. et al., Journal of Genetics and Genomics, 2021
  3. Barak Y. et al., J. Biol. Chem, 1995
  4. Chen Z. et al., BMC Cancer, 2020
  5. Shan K. et al., The Innovation, 2021
  6. Shuai H. et al., The Lancet, 2021
  7. Bate N. et al., biorxiv, 2021
  8. Smyth DS. et al., Nature, 2022
  9. Viana R. et al., Nature, 2022
  10. Colombo VC. et al., Transbound Emerg Dis., 2021
  11. Miot E. et al., Emerging Infectious Diseases, 2022
  12. George JA. et al., SAMJ, 2021
  13. Jassat W. et al., International Journal of Environmental Health Research, 2013
  14. Chelule PK. et al., Int J Environ Res Public Health, 2021
  15. Fagre A. et al., PLoS Pathog., 2021
  16. Martin DP. et al., biorxiv, 2022
  17. Dowdle WR. et al., Bull Pan Am Health Organ, 1976
  18. Cele S. et al., Cell Host & Microbe, 2022
  19. Riddell AC. et al., medrxiv, 2022
  20. Maponga TG. et al., SSRN, 2022
  21. Gobeil SMC. et al., biorxiv, 2022
  22. Kryazhimskiy S. et al., PLoS Genetics, 2008
  23. Morales AC. et al., Genome Biology and Evolution, 2021
  24. Braun KM. et al., PLoS Pathogens, 2021
  25. Hannon WW. et al., biorxiv, 2022
  26. Kemp SA. et al., Nature, 2021
  27. Oreshkova N. et al., Euro Surveill., 2021
  28. Zhu J. et al., Cell reports, 2022
  29. Gao Y. et al., Front Med., 2017
  30. Novitsky V. et al., PLoS One, 2016

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